Cyto2BM

Présentation

La plateforme Cyto2BM créé en 2018 regroupe les équipements communs de biologie moléculaire et de cytométrie en flux sur le site du Campus Saint Germain des Prés dans le 6 ième arrondissement de Paris. Elle intègre l’UMS BioMedTech facilities à sa création en 2019.
Nos équipements sont en accès libre après formation et réservation sur notre site en ligne : accès direct

Equipe

Equipements

Enspire (PerkinElmer): Lecteur multimode :

Plaque : 24/48/96 ½ puits/96/384 puits
Température contrôle jusqu’à 65°C, Agitations (linéaire)

 

-Absorbance (230-1000 nm)

-Fluorescence (monochromateur 230 – 850 nm) : lecture par-dessus ou par-dessous

-Luminescence (400-650 nm) : lecture par le haut uniquement

Fluorescence en temps résolu

Technologie alpha (520-620 nm)


Cytomètre analyseur Attune Tx

                                         

Analyseur 4 laser (405, 488, 562, 633 nm), 14 paramètres équipé d’un lecteur de plaque (autosampleur)

Configuration Attune :

Lasers
405 nm 488 nm 561 nm 633 nm
440/50 530/30 585/16 670/14
512/25 590/40 620/15 720/30
603/48 695/40 695/40 780/60
710/50 780/60

Vitesse de passage échantillon : 12,5μl/min à 1000 µl/min
Analyse évènement jusqu’à 30 000/s


Cytomètre Trieur ARIA III : buse 70 et 100 µm

Trieur 4 laser (405, 488, 562, 633 nm) 12 paramètres, équipé d’un module de clonage
Configuration ARIA III

Lasers
405 nm 488 nm 561 nm 633 nm
440/40 530/30 585/15 660/20
510/50 695/40 610/20 730/45
670/14 780/60
710/50
780/60

Pas de contrôle de la température
Récupération des échantillons : tube 15ml, tube FACS, Plaque 6/12/24/96/384 puits

 

GentelMACS : dissociation de tissus

Le dissociateur GENTEL MACS™ avec heaters (système pour chauffer l’échantillon) permet la dissociation de tissus. L’appareil peut accueillir huit échantillons maximum. Chaque position peut être utilisée indépendamment. Les tubes sont à usage unique permettent de préserver la stérilité de l’échantillon.

L’appareil est équipé de plusieurs programmes pour la dissociation des tissus en suspensions unicellulaires :
• Tumeur de souris ou humaine
• Cœur néonatal de souris ou de rat
• Tissu neural rate, poumon, lamina propria, épiderme ou foie de souris muscle squelettique de souris ou de rat

 

MultiMACS ™ Cell24 Separator : Trieur magnetique

Le MultiMACS ™ Cell24 Separator est un instrument permettant d’isolé une population cellulaire à l’aide d’un système de bille magnétique/aimant. L’appareil permet de gérer jusqu’à 24 échantillons en parallèle. La séparation est rapide et assure un traitement identique de tous échantillons pour des résultats hautement reproductibles. L’instrument est conçu pour l’isolation de tous les types de cellule de n’importe quelle source et est compatible avec de nombreux applications telles que : la biologie moléculaire l’analyse fonctionnelle, la cytométrie en flux, la culture cellulaire….

– Room H423A

 

Seahorse :

Les analyseurs Seahorse XF mesurent le taux de consommation d’oxygène (OCR) et le taux d’acidification extracellulaire (ECAR) des cellules vivantes dans une plaque multipuits pour étudier les fonctions cellulaires clés telles que la respiration mitochondriale et la glycolyse. Les instruments effectuent l’addition et le mélange de composés, la détection sans étiquette et le calcul automatique de l’OCR et de l’ECAR en temps réel.
Appareil de 24 puits

 

Appareils QPCR

3 Appareils de QPCR  Bio-Rad:

-2 CFX 384 puits : appareil de PCR Quantitative 384 puits Gradient, 4 Couleurs
-1 CFX 96 puits : Appareil de PCR Quantitative 96 puits Gradient avec le module HRM (High Resolution Melt Analysis ). L’analyse des courbes de fusion à haute résolution, ou High Resolution Melt est une technique de biologie moléculaire permettant la détection de mutations, de polymorphisme génétique et de différences épigénétiques dans des échantillons d’ADN double brin
– logiciel d’analyse CFX Maestro

Imageur gel/membrane (western blot)

– LAS 4000 (GE Healthcare) : acquisition chemiluminescence et fluorescence

-Fusion solo S (Vilber) : acquisition chemiluminescence

Nanodrop

Les spectrophotomètres NanoDrop™ permettent de réaliser des spectres d’absorbance pour micro-volume sans cuvette ni capillaire. Il permet des mesures sur une large gamme de longueurs d’onde pour l’analyse des spectres dans le visible, l’UV et la fluorescence
-Nanodrop 1000 et Nanodrop One : mesure de la DO dans l’ UV et le visible
-Nanodrop 3000 : Mesure DO en fluorescence

                              

Tarifs

Droit d'entrée annuel à la plateforme Cyto2BM
Tarif unique
Cytométrie + Biologie Moléculaire400€
Cytométrie250€
Biologie Moléculaire250€

Equipements
Tarif Membre CUSP (HT) Tarif académique Hors CUSP (HT) Privé (HT)
Utilisateur autonome Utilisateur "aidé" Utilisateur autonome Utilisateur "aidé" Utilisateur autonome Utilisateur "aidé"
cytomètre analyseur Attnue 22€ / h 27€ / h 35€ / h 45€ / h 55€ / h 65€ / h
cytomètre trieur ARIA III NA 200€ / tri NA 250€ / h NA 500€ / h
Seahorse
(sans fourniture de plaque)
NA 100€ / run NA 150€ / run NA 250€ / run
Seahorse
(avec fourniture de plaque)
NA 150€ / run NA 250€ / run NA 350€ / run
Forfait seahorse 10 run avec plaque NA 1200€ NA 2200€ NA NA
PCR en temps réel CFX384 CFX96 3€ / run 3€ / run 15€ / run 15€ / run 250€ / run NA
Enpire 1,5€ / run 1,5€ / run 2€ / run 2€ / run 5€ / run 5€ / run
Gentle MACS (tube non fourni) 3€ / run 3€ / run 15€ / run 15€ / run 50€ / run 50€ / run
Trieur : MultiMACS cells separator (colonnes non fournies) 5€ / run 5€ / run 100€ / run 100€ / run 150€ / run 150€ / run
Equipements
Tarif Membre CUSP (HT) Tarif académique Hors CUSP (HT) Privé (HT)
Utilisateur autonome Utilisateur « aidé » Utilisateur autonome Utilisateur « aidé » Utilisateur autonome Utilisateur « aidé »
cytomètre analyseur Attnue 23€ / h 28€ / h 35€ / h 45€ / h 55€ / h 65€ / h
cytomètre trieur ARIA III NA 200€ / tri NA 250€ / h NA 500€ / h
Forfait annuel Attune (50h) 950€ NA NA NA NA NA
Seahorse
(sans fourniture de plaque)
NA 100€ / run NA 150€ / run NA 250€ / run
Seahorse
(avec fourniture de plaque)
NA 150€ / run NA 250€ / run NA 350€ / run
Forfait seahorse 10 run avec plaque NA 1200€ NA 2200€ NA NA
PCR en temps réel CFX384 CFX96 3€ / run NA 15€ / run NA 50€ / run NA
Enspire 2€ / réservation NA 3€ / réservation NA 5€ / réservation NA
Gentle MACS (tube non fourni) 4€ / run NA 15€ / run NA 50€ / run NA
Trieur : MultiMACS cells separator (colonnes non fournies) 6€ / run 10€ / run 100€ / run 120€ / run 150€ / run 170€ / run

Accès

Retrouver la Plateforme Cyto2BM au 2ème étage du bâtiment des Saints-Pères et toutes les coordonnées d’accès en suivant ce lien.

Publications

Control of TLR7-mediated type I IFN signaling in pDCs through CXCR4 engagement-A new target for lupus treatment. Nikaïa Smith, Mathieu P Rodero, Nassima Bekaddour , Vincent Bondet, Yasser B Ruiz-Blanco, Mirja Harms, Benjamin Mayer, Brigitte Bader-Meunier, Pierre Quartier, Christine Bodemer, Véronique Baudouin, Yannick Dieudonné, Frank Kirchhoff, Elsa Sanchez Garcia, Bruno Charbit, Nicolas Leboulanger, Bernd Jahrsdörfer, Yolande Richard, Anne-Sophie Korganow, Jan Münch, Sébastien Nisole, Darragh Duffy, Jean-Philippe Herbeuval. Sci Adv 2019 Jul 10;5(7):eaav9019. doi: 10.1126/sciadv.aav9019. eCollection 2019 Jul.

Involvement of Aryl hydrocarbon receptor in myelination and in human nerve sheath tumorigenesis. Ghjuvan’Ghjacumu Shackleford, Nirmal Kumar Sampathkumar, Mehdi Hichor, Laure Weill, Delphine Meffre, Ludmila Juricek, Ingrid Laurendeau, Aline Chevallier, Nicolas Ortonne, Frédérique Larousserie, Marc Herbin, Ivan Bièche, Xavier Coumoul, Mathieu Beraneck, Etienne-Emile Baulieu, Frédéric Charbonnier, Eric Pasmant and Charbel Massaad. PNAS 2018 February, 115 (6) E1319-E1328.

A comprehensive characterization of the impact of mycophenolic acid on the metabolism of Jurkat T cells. Ana A. Fernández-Ramos, Catherine Marchetti-Laurent, Virginie Poindessous, Samantha Antonio, Céline Petitgas, Irène Ceballos-Picot, Pierre Laurent-Puig, Sylvie Bortoli, Marie-Anne Loriot & Nicolas Pallet. Sci Rep. 2017 Sep 5;7(1):10550.

1,2,4. 6-mercaptopurine promotes energetic failure in proliferating T cells. Oncotarget. Ana A. Fernández-Ramos1,2, Catherine Marchetti-Laurent1,2, Virginie Poindessous1,2, Samantha Antonio2,3, Pierre Laurent-Puig1,2,4, Sylvie Bortoli2,3, Marie-Anne Loriot1,2,4, Nicolas Pallet. 2017 Jun 27;8(26):43048-43060.

SNAT7 is the primary lysosomal glutamine exporter required for extracellular protein-dependent growth of cancer cells. Verdon, Q., Boonen, M., Ribes, C., Jadot, M., Gasnier, B. and Sagné, C. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 May 2;114(18)

Natural amines inhibit activation of human plasmacytoid dendritic cells through CXCR4 engagement. Smith N1,2, Pietrancosta N1,2, Davidson S3, Dutrieux J4, Chauveau L5, Cutolo P6, Dy M7, Scott-Algara D8, Manoury B9, Zirafi O10, McCort-Tranchepain I1, Durroux T11, Bachelerie F6, Schwartz O5, Münch J10, Wack A3, Nisole S4, Herbeuval JP1,2 . Nat Commun. 2017 Feb 9.

Paraquat Induces Peripheral Myelin Disruption and Locomotor Defects: Crosstalk with LXR and Wnt Pathways. Mehdi Hichor,1 Nirmal Kumar Sampathkumar,1 Julia Montanaro,1 Didier Borderie,1 Patrice X. Petit,1 Victor Gorgievski,2 Eleni T. Tzavara,2 Assaad A. Eid,3 Frédéric Charbonnier,1 Julien Grenier,1 and Charbel Massaad. Antioxid Redox Signal. 2016 Dec 19.

Demande de Brevet

Identification de la protéine SNAT7 comme cible thérapeutique des cancers dépendants de la glutamine. Demande de dépôt de brevet n° EP 16305785.4 déposée le 28 juin 2016 auprès de l’EPO. Verdon Q, Sagné C, Gasnier B. EXPERIMENTATION SUR LA PLATEFORME DE CYTOMETRIE EN FLUX