Cyto2BM

Présentation

La plateforme Cyto2BM créé en 2018 regroupe les équipements communs de biologie moléculaire et de cytométrie en flux sur le site du Campus Saint Germain des Prés dans le 6 ième arrondissement de Paris. Elle intègre l’UMS BioMedTech facilities à sa création en 2019.
Nos équipements sont en accès libre après formation et réservation sur notre site en ligne : accès direct

Actualités

Séminaire technologie QIAcuity Digital PCR System
La société Qiagen sera parmi nous les 27 et 28 mai pour nous faire découvrir le QIAcuity Digital PCR System. À cette occasion, nous organisons un séminaire technologique le 27 mai à 14h en salle P436 (présentation de l’appareil et analyse de résultats) © Tous droits...
Les visites insolites du CNRS
L'UAR BioMed Tech facilities participe à l'édition 2023 des visites insolites du CNRS. © Tous droits réservés Venez nous rendre visite le 11 octobre et découvrir nos animations 1) Nano, à votre santé ! et 2) La résonance magnétique nucléaire au service de la santé....
Webinaire de l’UMS
Thursday, April 7th, 2022 at 2:00 PM (CEST, Paris Time): Genetically Modified Mouse Model and Applications © Tous droits réservés - https://unsplash.com/ A glance at genome editing with CRISPR-Cas9 technology Experience sharing on mouse model generation What is Knock...
Webinaire Scanner Amersham™ Typhoon™ 5
Mardi 22 mars de 10h30 à 11h30 visioconférence: Améliorer la détection et la quantification de vos échantillons © Tous droits réservés Caractéristiques techniques et performances de l’Amersham Typhoon Applications en multifluorescence et colorimétrieExemples...

Equipe

Stéphanie DUPUY,

Responsable opérationnelle

IE – Université de Paris
adresse électronique:stephanie.dupuy@u-paris.fr
Tél.: 01 70 64 99 00

Mathieu RODERO

Référent scientifique

CR CNRS – UMR 8601
adresse électronique:
mathieu.rodero@u-paris.fr

Céline TOMKIEWICZ-RAULET

Membre associée

IR – INSERM
adresse électronique: celine.tomkiewicz@inserm.frTél. : 01 76 53 43 55

CODE PART POUR TEST BROOOO

Equipements

Enspire (PerkinElmer): Lecteur multimode :

Plaque : 24/48/96 ½ puits/96/384 puits
Température contrôle jusqu’à 65°C, Agitations (linéaire)

  • Absorbance (230-1000 nm)
  • Luminescence (400-650 nm) : lecture par le haut uniquement
  • Fluorescence (monochromateur 230 – 850 nm) : lecture par-dessus ou par-dessous
  • Technologie alpha (520-620 nm) : méthode de détection homogène sans lavage basée sur le transfert d’énergie luminescent entre billes, permettant une analyse rapide, sensible et hautement spécifique des interactions biomoléculaires. Exemple : étude des interactions protéine-protéine, détection et la quantification de protéines phosphorylées,détection d’interactions protéine-ADN ou protéine-ARN

Cytomètre analyseur Attune Tx

Analyseur 4 laser (405, 488, 562, 633 nm), 14 paramètres équipé d’un lecteur de plaque (autosampleur)
Configuration Attune :

Lasers
405 nm 488 nm 561 nm 633 nm
440/50 530/30 585/16 670/14
512/25 590/40 620/15 720/30
603/48 695/40 695/40 780/60
710/50 - 780/60 -

Vitesse de passage échantillon : 12,5μl/min à 1000 µl/min
Analyse évènement jusqu’à 30 000/s

Cytomètre analyseur Attune NxT

Instrument de cytométrie en flux qui permet d’analyser rapidement et avec précision les caractéristiques physiques et fluorescentes des cellules en suspension.

4 lasers (405, 488, 562, 633 nm), 14 paramètres
auto sampler (plaque 96 puit/ deepwell
focalisation acoustique.

Varioscan Lux

Absorbance (230-1000 nm)
Luminescence : (400-650 nm) : lecture par le haut uniquement
Fluorescence (monochromateur 230 – 850 nm) : lecture par-dessus ou par-dessous
Technologie HTRF (Homogeneous Time-Resolved Fluorescence) : méthode de détection basée sur le transfert d’énergie de fluorescence résolu dans le temps, permettant de mesurer de manière homogène et sensible des interactions biomoléculaires sans étape de lavage. Exemple : dosage de seconds messagers étude des interactions protéine-protéine, détection et la quantification de protéines phosphorylées,détection d’interactions protéine-ADN ou protéine-ARN

GentelMACS : dissociation de tissus

Le dissociateur GENTEL MACS™ avec heaters (système pour chauffer l’échantillon) permet la dissociation de tissus. L’appareil peut accueillir huit échantillons maximum. Chaque position peut être utilisée indépendamment. Les tubes sont à usage unique permettent de préserver la stérilité de l’échantillon.

L’appareil est équipé de plusieurs programmes pour la dissociation des tissus en suspensions unicellulaires :

  • Tumeur de souris ou humaine
  • Cœur néonatal de souris ou de rat
  • Tissu neural rate, poumon, lamina propria, épiderme ou foie de souris muscle squelettique de souris ou de rat

MultiMACS ™ Cell24 Separator : Trieur magnetique

Le MultiMACS ™ Cell24 Separator est un instrument permettant d’isolé une population cellulaire à l’aide d’un système de bille magnétique/aimant. L’appareil permet de gérer jusqu’à 24 échantillons en parallèle. La séparation est rapide et assure un traitement identique de tous échantillons pour des résultats hautement reproductibles. L’instrument est conçu pour l’isolation de tous les types de cellule de n’importe quelle source et est compatible avec de nombreux applications telles que : la biologie moléculaire l’analyse fonctionnelle, la cytométrie en flux, la culture cellulaire … 

Seahorse

Les analyseurs Seahorse XF mesurent le taux de consommation d’oxygène (OCR) et le taux d’acidification extracellulaire (ECAR) des cellules vivantes dans une plaque multipuits pour étudier les fonctions cellulaires clés telles que la respiration mitochondriale et la glycolyse. Les instruments effectuent l’addition et le mélange de composés, la détection sans étiquette et le calcul automatique de l’OCR et de l’ECAR en temps réel.
Appareil de 24 puits

Appareils QPCR

3 Appareils de QPCR Bio-Rad:

  • 2 CFX 384 puits : appareil de PCR Quantitative 384 puits Gradient, 4 Couleurs
  • 1 CFX 96 puits : Appareil de PCR Quantitative 96 puits Gradient avec le module HRM (High Resolution Melt Analysis ). L’analyse des courbes de fusion à haute résolution, ou High Resolution Melt est une technique de biologie moléculaire permettant la détection de mutations, de polymorphisme génétique et de différences épigénétiques dans des échantillons d’ADN double brin
  • logiciel d’analyse CFX Maestro

Imageur gel/membrane (western blot)

  •  LAS 4000 (GE Healthcare) : acquisition chemiluminescence et fluorescence

 

  • Fusion solo S (Vilber) : acquisition chemiluminescence

 

Nanodrop

Les spectrophotomètres NanoDrop™ permettent de réaliser des spectres d’absorbance pour micro-volume sans cuvette ni capillaire. Il permet des mesures sur une large gamme de longueurs d’onde pour l’analyse des spectres dans le visible, l’UV et la fluorescence
-Nanodrop 1000 et Nanodrop One : mesure de la DO dans l’ UV et le visible
-Nanodrop 3000 : Mesure DO en fluorescence

 

Odyssey M

L’Odyssey M possède une plage dynamique supérieure à 6- logs pour la Fluorescence et la Chimi/Bioluminescence. Grâce à cette possibilité, il n’y a pas de risque de saturation des signaux qui peuvent être détectés en une seule image avec des paramètres identiques ce qui augmente la reproductibilité. L’Odyssey M possède 18 canaux. Il est équipé de 4 lasers (LD 488 nm, LD 520 nm, LD 658 nm et LD 784nm) et d’une caméra CCD. Il permet à la fois d’imager des membranes (infrarouge, fluorescence) et des gels (protéiques et ADN et ARN), de lire des plaques (cellules vivantes ou fixés) et des lames histologiques, et de faire de la luminescence. L’Odyssey M peut acquérir des images avec une résolution maximum de 5 microns ce qui permet de scanner des lames histologiques ainsi que des spécimens biologiques en détail. Il est équipé de capteurs de dernière génération permettant une réduction considérable du bruit de fond, des fréquences d’images rapides, une large gamme dynamique, une efficacité quantique élevée, une haute résolution et un grand champ de vision simultanément dans une seule image. L’instrument est équipé de 2 portoirs permettant de réaliser de l’imagerie sur de nombreux supports expérimentaux : plaques (4 positions), membranes et gels (zone de scan 25 cm x18 cm) mais aussi sur des tissus (cerveau transparisé, embryon) ou des modèles animaux de petites tailles (lames, 12 positions). Pour plus d’information: https://www.licorbio.com/odyssey-m/applications

Tarifs

Droit d'entrée annuel à la plateforme Cyto2BM
Tarifs Tarif membre CUSP (HT) Tarif académique Hors CUSP (HT) Privé (HT)
Cytométrie + Biologie Moléculaire420€420€420€
Cytométrie260€260€260€
Biologie Moléculaire260€260€260€
Equipements
Tarif Membre CUSP (HT) Tarif académique Hors CUSP (HT) Privé (HT)
Utilisateur autonome Utilisateur "aidé" Utilisateur autonome Utilisateur "aidé" Utilisateur autonome Utilisateur "aidé"
cytomètre analyseur Attnue 22€ / h 27€ / h 35€ / h 45€ / h 55€ / h 65€ / h
cytomètre trieur ARIA III NA 200€ / tri NA 250€ / h NA 500€ / h
Seahorse
(sans fourniture de plaque)
NA 100€ / run NA 150€ / run NA 250€ / run
Seahorse
(avec fourniture de plaque)
NA 150€ / run NA 250€ / run NA 350€ / run
Forfait seahorse 10 run avec plaque NA 1200€ NA 2200€ NA NA
PCR en temps réel CFX384 CFX96 3€ / run 3€ / run 15€ / run 15€ / run 250€ / run NA
Enpire 1,5€ / run 1,5€ / run 2€ / run 2€ / run 5€ / run 5€ / run
Gentle MACS (tube non fourni) 3€ / run 3€ / run 15€ / run 15€ / run 50€ / run 50€ / run
Trieur : MultiMACS cells separator (colonnes non fournies) 5€ / run 5€ / run 100€ / run 100€ / run 150€ / run 150€ / run
Equipements
Tarif membre UPC campus Saint Germain (HT) Tarif membre UPC hors CSG (HT) Tarif académique Hors UPC (HT) Privé (HT)
Utilisateur autonome Utilisateur « aidé » Utilisateur autonome Utilisateur « aidé » Utilisateur autonome Utilisateur « aidé » Utilisateur autonome Utilisateur « aidé »
cytomètre analyseur Attnue 25€ / h 30€ / h 40€ / h 50€ / h 50€ / h 65€ / h 75€ / h 100€ / h
Forfait annuel Attune (50h) 1000€ NA NA NA NA NA NA NA
Instrument d’imagerie (LAS4000, Odyssey M, Fusion) 1€ NA NA NA NA NA 4€ NA
Seahorse
(sans fourniture de plaque)
NA 100€ / run NA 120€ / run NA 150€ / run NA 250€ / run
PCR en temps réel CFX384 CFX96 3€ / run NA 10€ / run NA 15€ / run NvvA 50€ / run NA
Enpire 2€ / réservation NA 2.5€ / réservation NA 3€ / réservation NA 5€ / réservation NA
Gentle MACS (tube non fourni) 4€ / run NA 8€ / run NA 15€ / run NA 50€ / run NA
Trieur : MultiMACS cells separator 6€ / run 10€ / run 8€ / run 20€ / run 100€ / run 120€ / run 150€ / run 170€ / run

Accès

Retrouver la Plateforme Cyto2BM au 2ème étage du bâtiment des Saints-Pères et toutes les coordonnées d’accès en suivant ce lien.

Publications

Control of TLR7-mediated type I IFN signaling in pDCs through CXCR4 engagement-A new target for lupus treatment. Nikaïa Smith, Mathieu P Rodero, Nassima Bekaddour , Vincent Bondet, Yasser B Ruiz-Blanco, Mirja Harms, Benjamin Mayer, Brigitte Bader-Meunier, Pierre Quartier, Christine Bodemer, Véronique Baudouin, Yannick Dieudonné, Frank Kirchhoff, Elsa Sanchez Garcia, Bruno Charbit, Nicolas Leboulanger, Bernd Jahrsdörfer, Yolande Richard, Anne-Sophie Korganow, Jan Münch, Sébastien Nisole, Darragh Duffy, Jean-Philippe Herbeuval. Sci Adv 2019 Jul 10;5(7):eaav9019. doi: 10.1126/sciadv.aav9019. eCollection 2019 Jul.

Involvement of Aryl hydrocarbon receptor in myelination and in human nerve sheath tumorigenesis. Ghjuvan’Ghjacumu Shackleford, Nirmal Kumar Sampathkumar, Mehdi Hichor, Laure Weill, Delphine Meffre, Ludmila Juricek, Ingrid Laurendeau, Aline Chevallier, Nicolas Ortonne, Frédérique Larousserie, Marc Herbin, Ivan Bièche, Xavier Coumoul, Mathieu Beraneck, Etienne-Emile Baulieu, Frédéric Charbonnier, Eric Pasmant and Charbel Massaad. PNAS 2018 February, 115 (6) E1319-E1328.

A comprehensive characterization of the impact of mycophenolic acid on the metabolism of Jurkat T cells. Ana A. Fernández-Ramos, Catherine Marchetti-Laurent, Virginie Poindessous, Samantha Antonio, Céline Petitgas, Irène Ceballos-Picot, Pierre Laurent-Puig, Sylvie Bortoli, Marie-Anne Loriot & Nicolas Pallet. Sci Rep. 2017 Sep 5;7(1):10550.

1,2,4. 6-mercaptopurine promotes energetic failure in proliferating T cells. Oncotarget. Ana A. Fernández-Ramos1,2, Catherine Marchetti-Laurent1,2, Virginie Poindessous1,2, Samantha Antonio2,3, Pierre Laurent-Puig1,2,4, Sylvie Bortoli2,3, Marie-Anne Loriot1,2,4, Nicolas Pallet. 2017 Jun 27;8(26):43048-43060.

SNAT7 is the primary lysosomal glutamine exporter required for extracellular protein-dependent growth of cancer cells. Verdon, Q., Boonen, M., Ribes, C., Jadot, M., Gasnier, B. and Sagné, C. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 May 2;114(18)

Natural amines inhibit activation of human plasmacytoid dendritic cells through CXCR4 engagement. Smith N1,2, Pietrancosta N1,2, Davidson S3, Dutrieux J4, Chauveau L5, Cutolo P6, Dy M7, Scott-Algara D8, Manoury B9, Zirafi O10, McCort-Tranchepain I1, Durroux T11, Bachelerie F6, Schwartz O5, Münch J10, Wack A3, Nisole S4, Herbeuval JP1,2 . Nat Commun. 2017 Feb 9.

Paraquat Induces Peripheral Myelin Disruption and Locomotor Defects: Crosstalk with LXR and Wnt Pathways. Mehdi Hichor,1 Nirmal Kumar Sampathkumar,1 Julia Montanaro,1 Didier Borderie,1 Patrice X. Petit,1 Victor Gorgievski,2 Eleni T. Tzavara,2 Assaad A. Eid,3 Frédéric Charbonnier,1 Julien Grenier,1 and Charbel Massaad. Antioxid Redox Signal. 2016 Dec 19.

Demande de Brevet

Identification de la protéine SNAT7 comme cible thérapeutique des cancers dépendants de la glutamine. Demande de dépôt de brevet n° EP 16305785.4 déposée le 28 juin 2016 auprès de l’EPO. Verdon Q, Sagné C, Gasnier B. EXPERIMENTATION SUR LA PLATEFORME DE CYTOMETRIE EN FLUX

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